networkx节点顺序 - 垂直打印graphviz布局
我创建了一个图形布局，使用了Graphviz这个工具。我还尝试过用不同的绘图风格来画图，比如随机、圆形、壳层、谱系和弹簧。我觉得Graphviz最能准确反映我的数据。我制作了一个文件，里面有两列字符串，这些字符串代表了边（每个字符串至少有一个对应的伙伴，这就是我认为Graphviz布局最能代表这些数据的原因）。从这个文件中，我创建了一个独特字符串的列表，作为节点。然后我把这些节点画出来，并添加了边。我的脚本的一个版本可以在这里找到：(networkx - 根据列表或字典值改变节点大小)
这是使用Graphviz布局的输出（这里的大小是原来的100乘以10，有些数字高达15020，有些则小到10）：
这是使用随机布局的输出：
我们能否得出结论，Graphviz示例中所有应该存在的边都存在？可以说较小的节点“在”较大的节点上面是连接的吗？有没有办法让它们的边可见？在随机示例中，是否因为节点的随机放置，导致有更多的边可见，从而边的“长度”可以更长？
如果我认为的没错，Graphviz是我数据的最佳绘图选项，因为节点和边之间有很多重叠（如果那些“在”较大节点上的节点确实是连接的），我想做的是把图按“垂直”方式排序。也就是说，把最大的节点和最多边的放在上面，往下排列到只有1条边的节点。我尝试过改变整体图形的大小，但并没有让图形更清晰。不知道为什么，我得到了一个原始窗口显示图形，还有一个灰色空白背景的二级窗口。
所以，我开始觉得我的一些假设是正确的。这是我能做的最大尺寸的图像：
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发生的情况是，networkx把节点画在边的上面。所以边是在节点下面画的。
我觉得最简单的办法让你还能看到边，就是在draw命令里设置alpha=0.5，或者其他小于1的值，这样节点就会变得半透明。