使用genfromtxt时出现空字符串
谢谢你的耐心,我对Python还很陌生。输入文件是一个用制表符分隔的表格。
import numpy as np
#from StringIO import StringIO
inputfile=raw_input('Filepath please: ')
fieldnames='Reference Position, Type, Length, Reference, Allele, Linkage, Zygosity, \
Count, Coverage, Frequency, Hyper-allelic, Forward/reverse balance, Average quality, \
Overlapping annotations, Coding region change, Amino acid change'
fieldtypes='int,str,int,str,str,str,str,int,int,float,str,float,float,str,str,str'
with open(inputfile) as f:
storage=np.genfromtxt(f, skip_header=1, delimiter='\t', names=fieldnames, dtype=fieldtypes)
print storage
我遇到了一个ValueError错误:元组的大小必须和字段数量匹配。
有人能帮忙吗?
更新:
好吧,在采纳了@Wooble的建议后,错误消失了……
更新2:
但现在的问题是,当我打印存储的内容时,所有类型为字符串的单元格都是空字符串('')。这是为什么呢?
更新3:我通过把上面的字符串类型改成|S#(#是一个整数)解决了空字符串的问题。
1 个回答
1
但是现在的问题是,当我打印存储的内容时,所有类型为字符串(str)的单元格都是空字符串('')。这是为什么呢?
编辑3:我通过把上面的字符串类型改成|S#来解决了空字符串的问题,这里的#是一个整数。
编辑4:请看下面Jinan Dangor的评论。