对两个向量列表进行“逐元素”点积的 numpy.einsum 更快的替代方案?
假设你有两个向量数组:
v1 = np.array([ [1, 2], [3, 4] ])
v2 = np.array([ [10, 20], [30, 40]])
我们想要生成一个新的数组,它的内容相当于:
v3 = np.array([ np.dot(v1[0], v2[0]), np.dot(v1[1], v2[1]) ])
目前我使用的是:
v3 = np.einsum('ij,ij->i', v1, v2)
不过,我在代码中这样做的次数非常多,所以如果能加快速度对我来说会很有帮助。
我们怎么能加快这个过程呢?虽然np.einsum
已经相当高效了,但我在想,对于这个特定的用例,有没有更快的方法呢?
2 个回答
1
试试 inner1d
import numpy as np
import cProfile
from numpy.core.umath_tests import inner1d
v1 = np.random.random((10**7,2,)) # 10 million random vectors
v2 = np.random.random((10**7,2,)) # 10 million random vectors
v3 = np.einsum('ij,ij->i', v1, v2) # einsum
v4 = inner1d(v1,v2) # inner1d (~2x faster than einsum)
cProfile.run("np.einsum('ij,ij->i', v1, v2)") # cProfile: 3 function calls in 0.065 seconds
cProfile.run("inner1d(v1,v2)") # cProfile: 2 function calls in 0.033 seconds
print np.allclose(v3,v4) # Returns True
2
einsum
是我能想到的三种选择中最好的一个:
In [73]: timeit v3=np.einsum('ij,ij->i',v1,v2)
100000 loops, best of 3: 5.14 us per loop
In [74]: timeit np.diag(np.dot(v1,v2.T))
100000 loops, best of 3: 7.43 us per loop
In [75]: timeit np.sum(v1*v2,axis=1)
100000 loops, best of 3: 16.8 us per loop
有几个问题需要考虑:
- 这个计算真的那么耗费资源吗?
- 如果确实比较耗费资源,你需要经常进行这样的计算吗?
- 能否把多个
einsum
的调用合并起来 - 把数组连接在一起?