python命令行应用程序，用于检测微生物分支中的基因组岛插入。
xenoG的Python项目详细描述
要求
NCBI爆炸+
我们需要blast p和makeblastdb可执行文件（ ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/latest/ ）。
蟒蛇3
包依赖项
- 生物圈（http://biopython.org/" rel="nofollow">http://biopython.org/）。这是用于分析genbank文件的，可以使用pip:
-
pip3安装biopython
< DL> - Parasail（https://github.com/jeffdaily/Parasail" rel="nofollow">https://github.com/jeffdaily/Parasail）。这是一个优化的比对库，用于计算蛋白质之间的分数。也可以使用pip:
- PIP3安装Parasail
- numpy（http://www.numpy.org/" rel="nofollow">http://www.numpy.org/）。
- pip3安装numpy
- scipy（https://www.scipy.org/" rel="nofollow">https://www.scipy.org/）。 pip3安装scipy
< DL> < DL>
（您使用的pip需要对应于python 3的一个版本。在某些情况下，它可能只是被称为pip而不是pip3）。
其他依赖项
如果使用 makeSpeciesTree 标志，还需要以下内容
- 肌肉（https://www.drive5.com/muscle/" rel="nofollow">https://www.drive5.com/muscle/）。
- 快速树（http://www.microbesonline.org/fastree/" rel="nofollow">http://www.microbesonline.org/fastree/）。
- 阿斯特拉尔（ https://github.com/smirarab/astral/ ）。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
