Python swalign-0.3.6.tar.gz模块包


下面是该Python项目安装包的资源下载地址:

  • swalign-0.3.6.tar.gz.source

  • 文件名称:swalign-0.3.6.tar.gz

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    所属PyPI项目:swalign


  • 文件大小: 7.7 kB

    文件类型: Source

    适用的Python版本:None

    下载文件的哈希值:
        SHA256:fc8fbfc603169491bddd48a6ff7d8514b603adb67bf4fc9873ed02645471329b
        MD5:950a8e9c7d2e5586226305a85f29b3fc
        BLAKE2-256:52c54451a983da4297bdb5e7638139e6dc4041830549cbb6229562bab3e77236






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PyPI项目包:swalign

swalign公司 ==

这个包实现了一个Smith-Waterman风格的局部对齐算法。你 可以将查询序列与引用对齐。评分函数可以基于 在矩阵或简单恒等式上。重量可根据匹配/不匹配进行调整 和差距,差距扩大处罚。另外,差距惩罚可以是 受衰退影响,以优先考虑长间隔。

输入文件是fasta格式的序列或序列字符串。

下面是一些入门的基本代码:

import swalign # choose your own va

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