Python swalign-0.3.6.tar.gz模块包
下面是该Python项目安装包的资源下载地址:
swalign-0.3.6.tar.gz.source
文件名称:swalign-0.3.6.tar.gz
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所属PyPI项目:swalign
文件大小: 7.7 kB
文件类型: Source
适用的Python版本:None
下载文件的哈希值:
SHA256:fc8fbfc603169491bddd48a6ff7d8514b603adb67bf4fc9873ed02645471329b
MD5:950a8e9c7d2e5586226305a85f29b3fc
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851 ℃ | 2024-05-26
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PyPI项目包:swalign
swalign公司 ==
这个包实现了一个Smith-Waterman风格的局部对齐算法。你 可以将查询序列与引用对齐。评分函数可以基于 在矩阵或简单恒等式上。重量可根据匹配/不匹配进行调整 和差距,差距扩大处罚。另外,差距惩罚可以是 受衰退影响,以优先考虑长间隔。
输入文件是fasta格式的序列或序列字符串。
下面是一些入门的基本代码:
import swalign # choose your own va
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