Python stpipeline-1.7.9-py3.7-macosx-10.7-x86_64.egg模块包


下面是该Python项目安装包的资源下载地址:

  • stpipeline-1.7.9-py3.7-macosx-10.7-x86_64.egg.egg

  • 文件名称:stpipeline-1.7.9-py3.7-macosx-10.7-x86_64.egg

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    所属PyPI项目:stpipeline


  • 文件大小: 238.1 kB

    文件类型: Egg

    适用的Python版本:3.7

    下载文件的哈希值:
        SHA256:fb382a5102ffd938b90f379b7d82a8cdbd7a1579fb3912b0f0174b9366218091
        MD5:f36815a53ab6193bd6478a5e52df9e4f
        BLAKE2-256:46b3089b3127f83ffb67a5f274de1e4d9bb61cd14d08aa6e65842fbc022069e8






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PyPI项目包:stpipeline

st管道包含处理所需的工具和脚本 并分析由空间转录组学生成的原始文件 方法以FastQ格式生成数据集以进行下游分析。 ST管道还可用于处理单个单元格数据 只要提供一个带有标识每个单元格的条形码的文件。 st管道还可以处理 或者没有umis。

ST管道已经过速度、稳健性和 易于使用与许多参数来调整所有设置。

需要以下文件/参数:

  • fastq文件(读取1,包含空间信息和umi 阅读包含基因组序列的2)
  • 用star生成的基因

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