Python stpipeline-1.7.9-py3.7-macosx-10.7-x86_64.egg模块包
下面是该Python项目安装包的资源下载地址:
stpipeline-1.7.9-py3.7-macosx-10.7-x86_64.egg.egg
文件名称:stpipeline-1.7.9-py3.7-macosx-10.7-x86_64.egg
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所属PyPI项目:stpipeline
文件大小: 238.1 kB
文件类型: Egg
适用的Python版本:3.7
下载文件的哈希值:
SHA256:fb382a5102ffd938b90f379b7d82a8cdbd7a1579fb3912b0f0174b9366218091
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PyPI项目包:stpipeline
st管道包含处理所需的工具和脚本 并分析由空间转录组学生成的原始文件 方法以FastQ格式生成数据集以进行下游分析。 ST管道还可用于处理单个单元格数据 只要提供一个带有标识每个单元格的条形码的文件。 st管道还可以处理 或者没有umis。
ST管道已经过速度、稳健性和 易于使用与许多参数来调整所有设置。
需要以下文件/参数:
- fastq文件(读取1,包含空间信息和umi 阅读包含基因组序列的2)
- 用star生成的基因查看全文