Python phylostan-1.0.3.tar.gz模块包
下面是该Python项目安装包的资源下载地址:
phylostan-1.0.3.tar.gz.source
文件名称:phylostan-1.0.3.tar.gz
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所属PyPI项目:phylostan
文件大小: 17.0 kB
文件类型: Source
适用的Python版本:None
下载文件的哈希值:
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851 ℃ | 2024-06-11
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PyPI项目包:phylostan
利用stan进行系统发育推断
简介
phylostan是一个用python编写的工具,用于从核苷酸数据集推断系统发生树。 它使用stan语言生成各种系统发育模型。 通过pystan库,phylostan可以访问stan的变分推理和采样(nuts和hmc)引擎。
功能
系统发育模型组成:
- 核苷酸替代模型:JC69,hky,gtr
- 利率异质性:离散威布尔分布查看全文