Python phylostan-1.0.3.tar.gz模块包


下面是该Python项目安装包的资源下载地址:

  • phylostan-1.0.3.tar.gz.source

  • 文件名称:phylostan-1.0.3.tar.gz

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    所属PyPI项目:phylostan


  • 文件大小: 17.0 kB

    文件类型: Source

    适用的Python版本:None

    下载文件的哈希值:
        SHA256:22f2b05c5b8f87d5611c477b4e12fc324862ad254e8d034aaf123fe98d4bf1e6
        MD5:aaaeb411b661da7f9ed4a0e3e17e52e3
        BLAKE2-256:7cb84c00a075f5f3b7442ceb5ac19f1af807b4cb1b427093deb1f6ec51064a44






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PyPI项目包:phylostan

利用stan进行系统发育推断

简介

phylostan是一个用python编写的工具,用于从核苷酸数据集推断系统发生树。 它使用stan语言生成各种系统发育模型。 通过pystan库,phylostan可以访问stan的变分推理和采样(nuts和hmc)引擎。

功能

系统发育模型组成:

  • 核苷酸替代模型:JC69,hky,gtr
  • 利率异质性:离散威布尔分布

    查看全文