python中的神经成像:管道和接口
nipype的Python项目详细描述
当前的神经成像软件为用户提供了一个难以置信的机会 使用各种不同的算法分析数据。然而,这已经 导致了专门应用程序的异构集合 没有透明的互操作性或统一的操作界面。
nipype,在 是一个python项目,它提供了 与现有的神经影像软件统一界面,便于交互 在单个工作流中的这些包之间。nipype提供了一个环境 这鼓励了对不同算法的交互式探索 包装(例如,AFNI、蚂蚁、大脑、智能套件、卡米诺、自由冲浪、FSL、MNE, mrtrix,mne,nipy,slicer,spm),简化了 在包之间,并减少使用不同包所需的学习曲线。NIPYPE正在用高级语言创建神经成像软件开发的协作平台,并解决现有管道系统的局限性。
nipype允许您:
- 轻松与来自不同软件包的工具进行交互
- 组合不同软件包中的处理步骤
- 通过重用旧工作流中的常用步骤,更快地开发新工作流
- 通过在多个核心/机器上并行运行数据,可以更快地处理数据
- 使您的研究易于重复
- 与社区共享您的处理工作流