Python ngCGH-0.4.4.tar.gz模块包
下面是该Python项目安装包的资源下载地址：
ngCGH-0.4.4.tar.gz.source
文件名称：ngCGH-0.4.4.tar.gz
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所属PyPI项目：ngCGH
文件大小： 7.2 kB
文件类型： Source
适用的Python版本：None
下载文件的哈希值：
SHA256：c70dc6ce02909eca974329c942a8c1a9326f0d12a6cf6e2e7eebcdb578a068e7
MD5：fad2de2cb68991b75e0e04a7906981da
BLAKE2-256：a54dad321b8149233d58c2386d45a05d1baa01ed519c469d8e6f239343f215d8
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851 ℃ | 2024-06-16
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PyPI项目包：ngCGH
概述
下一代肿瘤/正常对测序提供了一个很好的机会来检测肿瘤相对于正常样本的大规模拷贝数变化。实际上，这一概念似乎甚至延伸到对肿瘤和正常人的外显子捕获序列。这个库由一个单独的脚本ngcgh组成，该脚本使用简单的肿瘤相对于正常肿瘤的覆盖率计算一个伪cgh。
我选择在普通样本中使用固定数量的读取作为“窗口”方法。这样做的好处是产生拷贝数估计值，在每个位置都应该有相似的方差。该算法将自适应地处理基因组中的不均匀性，如与外显子捕
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