moclo系统逻辑的python实现。


moclo的Python项目详细描述

系统逻辑的python实现。

SourcePyPITravisDocsCodecovCodacyFormatLicense

要求

biopython Sequence handling PyPI biopython Source biopython License biopython
cached-property Lazy regex evaluation PyPI cached-property Source cached-property License cached-property
six Python 2/3 compatibility PyPI six Source six License six

安装

此软件包作为wheel提供,可以与pip:一起安装

$ pip install --user moclo

要了解更多安装方法,请转到Installation 联机文档的第页。

套件

就其本身而言,moclo不是很有用。能够模拟moclo组件 您可以安装以下一些工具包:

  • moclo-ytk:莫克罗酵母工具包, john dueber lab和pichia工具包,volker sieber lab
  • moclo-cidar:杀摩卡试剂盒, douglas densmore实验室
  • moclo-ecoflex:莫克洛埃科弗莱斯, paul freemont实验室
  • moclo-ig:图标遗传学摩洛, Sylvestre Marillonnet实验室
  • moclo-gb3:金色辫子3.0, diego orzaez实验室

工具包附带了moclo逻辑的具体实现(使用dna 参考文件中的签名和限制性内切酶),以及官方文件 从AddGene获得的序列,并手动 具有更高质量特征的注释。这些序列可以通过 使用注册表接口的moclo.registry模块。

关于

这个库是根据MIT License授权的。 它是在 InBio team 2018年夏天在巴黎巴斯德学院。

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