SciLifeLab长期支持工作流

lts_workflows的Python项目详细描述


LTS工作流

Documentation Statushttps://anaconda.org/percyfal/lts-workflows/badges/version.svghttps://img.shields.io/badge/License-GPL%20v3-blue.svg

sciliflab的助手函数、实用程序和docker映像 支持(LTS)工作流。

功能

此存储库是LTS工作流的主要入口点。它 不提供任何工作流代码/本身/,而是提供以下内容:

  • pytest用于设置测试的包装器
  • 用于创建工作流图像的基Docker图像
  • 适用于所有LTS工作流的常规docs

有关详细信息,请参见docs

学分

这个包是用Cookiecutteraudreyr/cookiecutter-pypackage项目模板创建的。

历史记录

0.2.5(2018-04-05)

  • 更改为使用ubuntu作为基本docker映像并删除乳胶包
  • 已删除nextflow环境

0.2.4(2017-11-14)

  • 修补程序:从安装要求中删除versioner(问题24)

0.2.3(2017-11-14)

  • 添加安装要求以在Docker映像中安装标记的LTS工作流版本

0.2.2(2017-11-13)

  • 向snakemake_run添加选项(第23期)

0.2.1(2017-09-26)

  • conda/meta.yaml的细微更改
  • 更新文档
  • 更新开发要求
  • 添加snakemake实用程序
  • 在Docker中添加不可变性字体
  • CRLF到LF和Dockerfile组织
  • 使用Conda Build All生成Conda Build(问题22)
  • 修复慢测试的pytest标记(问题19)
  • 添加pytest入口点(第18期)
  • 将configfile选项添加到pytest(问题16)
  • 将子进程stderr重定向到stdout并使用stdout变量(问题17)

0.2.0(2017-03-21)

  • 添加Docker Base图像并使其变小(第3期)
  • 更新文档

0.1.1(2017-03-01)

  • 将threads参数转换为字符串(问题7)
  • 将填充布局添加到辅助功能(问题4)

0.1.0(2017-02-12)

  • conda上的第一个版本。

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