Python hic_straw-0.0.6-py3-none-any.whl模块包


下面是该Python项目安装包的资源下载地址:

  • hic_straw-0.0.6-py3-none-any.whl.wheel

  • 文件名称:hic_straw-0.0.6-py3-none-any.whl

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    所属PyPI项目:hic-straw


  • 文件大小: 8.9 kB

    文件类型: Wheel

    适用的Python版本:py3

    下载文件的哈希值:
        SHA256:fd355fddfb43bb7a152125200a96a959bbe2fa3e4f5e1d41d0af8f27ebecf69e
        MD5:397f002b6eda54d3a7eeb7af349cb9cb
        BLAKE2-256:a4891fc2a4e6d9b5379ac4ea0add62658d519095d22a8fef6feb32d1f6d04341






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PyPI项目包:hic-straw

吸管

straw允许对.hic文件进行编程访问。 .hic文件存储hi-c实验的接触矩阵和 规范化和期望向量,以及头中的元数据。

主要函数straw接受规范化、文件名或URL, 染色体1(可选范围)、染色体2(可选范围) 所需的bin是以片段还是以基对分隔,以及bin大小

然后读取报头,跟随各种指向所需矩阵的指针 和标准化向量,存储为[x,y,count]

Usage

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