Python hic-straw-0.0.6.tar.gz模块包


下面是该Python项目安装包的资源下载地址:

  • hic-straw-0.0.6.tar.gz.source

  • 文件名称:hic-straw-0.0.6.tar.gz

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    所属PyPI项目:hic-straw


  • 文件大小: 7.2 kB

    文件类型: Source

    适用的Python版本:None

    下载文件的哈希值:
        SHA256:bc79be50b076a3820852cd0e3b0d743df719b78d49510bf43ac63241f03ab81a
        MD5:05bb911adabf50a1da778a5c3bd76173
        BLAKE2-256:5812da9e47221a82011797d19832a2dbc8843b0a96c483874f17010b4921c993






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PyPI项目包:hic-straw

吸管

straw允许对.hic文件进行编程访问。 .hic文件存储hi-c实验的接触矩阵和 规范化和期望向量,以及头中的元数据。

主要函数straw接受规范化、文件名或URL, 染色体1(可选范围)、染色体2(可选范围) 所需的bin是以片段还是以基对分隔,以及bin大小

然后读取报头,跟随各种指向所需矩阵的指针 和标准化向量,存储为[x,y,count]

Usage

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