Python hic-straw-0.0.6.tar.gz模块包
下面是该Python项目安装包的资源下载地址:
hic-straw-0.0.6.tar.gz.source
文件名称:hic-straw-0.0.6.tar.gz
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所属PyPI项目:hic-straw
文件大小: 7.2 kB
文件类型: Source
适用的Python版本:None
下载文件的哈希值:
SHA256:bc79be50b076a3820852cd0e3b0d743df719b78d49510bf43ac63241f03ab81a
MD5:05bb911adabf50a1da778a5c3bd76173
BLAKE2-256:5812da9e47221a82011797d19832a2dbc8843b0a96c483874f17010b4921c993
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851 ℃ | 2024-05-17
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PyPI项目包:hic-straw
吸管
straw允许对.hic
文件进行编程访问。
.hic
文件存储hi-c实验的接触矩阵和
规范化和期望向量,以及头中的元数据。
主要函数straw接受规范化、文件名或URL, 染色体1(可选范围)、染色体2(可选范围) 所需的bin是以片段还是以基对分隔,以及bin大小
然后读取报头,跟随各种指向所需矩阵的指针 和标准化向量,存储为[x,y,count]
Usage