panda数据帧中的gff标注

gffpandas的Python项目详细描述


gffpandas

https://img.shields.io/pypi/v/gffpandas.svghttps://img.shields.io/travis/foerstner-lab/gffpandas.svgDocumentation Status

panda数据框中的gff注释

关于gffpandas

gffpandas是一个python库,可用于处理注释数据。它有助于使用gff3文件过滤gff3文件所需的注释条目。gff3文件包含有关基因组特征的位置和属性的信息。gffpandas库是一个易于使用且节省时间的库。

这个gff pandas库是gffutils或bcbio gff的替代品,但它的灵感来自python库pandas。这意味着数据帧结构用于处理注释数据。使用gffpandas,可以通过不同的函数过滤gff3文件。一个很大的优点是可以组合多个过滤函数,以便可以选择所需的注释条目。此外,过滤后的注释数据能否作为gff3文件或csv或tsv文件再次安全。

有关文档,请参见gffpandas_repository

学分

这个包是用Cookiecutteraudreyr/cookiecutter-pypackage项目模板创建的。

历史记录

1.2.0(2019-03-13)

  • 为几种可能的功能过滤类型的功能

1.1.0(2019-03-13)

  • 现在可以按属性获取多个值的“功能”

1.0.1(2019-03-06)

  • 添加类型批注

1.0.0(2019-03-05)

  • 更改github url

0.1.2(2018-09-07)

  • 删除小文本错误

0.1.1(2018-09-07)

  • pypi上的第一个版本

0.1.0(2017-07-11)

  • 项目开始gffpandas

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