panda数据帧中的gff标注
gffpandas的Python项目详细描述
gffpandas
panda数据框中的gff注释
- 免费软件:ISC许可证
- 文档:https://gffpandas.readthedocs.io。
关于gffpandas
gffpandas是一个python库,可用于处理注释数据。它有助于使用gff3文件过滤gff3文件所需的注释条目。gff3文件包含有关基因组特征的位置和属性的信息。gffpandas库是一个易于使用且节省时间的库。
这个gff pandas库是gffutils或bcbio gff的替代品,但它的灵感来自python库pandas。这意味着数据帧结构用于处理注释数据。使用gffpandas,可以通过不同的函数过滤gff3文件。一个很大的优点是可以组合多个过滤函数,以便可以选择所需的注释条目。此外,过滤后的注释数据能否作为gff3文件或csv或tsv文件再次安全。
有关文档,请参见gffpandas_repository。
学分
这个包是用Cookiecutter和audreyr/cookiecutter-pypackage项目模板创建的。
历史记录
1.2.0(2019-03-13)
- 为几种可能的功能过滤类型的功能
1.1.0(2019-03-13)
- 现在可以按属性获取多个值的“功能”
1.0.1(2019-03-06)
- 添加类型批注
1.0.0(2019-03-05)
- 更改github url
0.1.2(2018-09-07)
- 删除小文本错误
0.1.1(2018-09-07)
- pypi上的第一个版本
0.1.0(2017-07-11)
- 项目开始gffpandas