Python domain_classifier-0.0.4.tar.gz模块包


下面是该Python项目安装包的资源下载地址:

  • domain_classifier-0.0.4.tar.gz.source

  • 文件名称:domain_classifier-0.0.4.tar.gz

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    所属PyPI项目:domain-classifier


  • 文件大小: 8.8 kB

    文件类型: Source

    适用的Python版本:None

    下载文件的哈希值:
        SHA256:f70b1078550736277514bff61fbc17e5d4db6f351288da0e2f0b71a29b48c962
        MD5:62faf17268800327fb1ed87a89f79783
        BLAKE2-256:63da0b8fc951fb57c22336f4637ae52ef745f04f2d30ca59e775c2a982847ad4






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PyPI项目包:domain-classifier

域分类器-使用pfam域将序列分类到其分类域

安装

pip安装域分类器

如何使用

输入通常是一个dna fasta序列,它将被翻译成蛋白质,并搜索pfam结构域。这些结构域将用于将每个序列分为四个结构域之一:细菌、真核生物、古细菌和病毒。其主要思想是让用户在不知道参考基因组的地方容易发现污染。由于蛋白质结构域在上述分类结构域之间具有高度的区别(绑架宿主基因的病毒除外),因此这种区别是相当容易的。

首先,您必须

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