创建SAV统计信息。在Python2.7中运行
bbcu.reportIlluminaInterop的Python项目详细描述
包装:bbcu.reportilluminainterop
该包创建包含排序运行统计信息的文件(illumina的hiseq或nextseq机器)。
run命令是:
run-sav-stat.py–输入文件夹输入文件夹–输出文件输出文件
输入文件夹-运行计算机的文件夹。需要像这样:180717_nb551168_0163_ahf727bgx7 输出文件-输出文件的名称(扩展名为.txt)。
输出文件的示例在“examples”文件夹下。
您可以使用逗号将其转换为PDF格式:
pandoc-o output_file.pdf–variable=几何图形:横向输出文件
由Refael Kohen开发(refael.kohen@gmail.com)
生命科学核心设施的生物信息学部门(LSCF),
魏茨曼科学研究所
基于python包互操作。