创建SAV统计信息。在Python2.7中运行

bbcu.reportIlluminaInterop的Python项目详细描述


包装:bbcu.reportilluminainterop

该包创建包含排序运行统计信息的文件(illumina的hiseq或nextseq机器)。

run命令是:

run-sav-stat.py–输入文件夹输入文件夹–输出文件输出文件

输入文件夹-运行计算机的文件夹。需要像这样:180717_nb551168_0163_ahf727bgx7 输出文件-输出文件的名称(扩展名为.txt)。


输出文件的示例在“examples”文件夹下。

您可以使用逗号将其转换为PDF格式:

pandoc-o output_file.pdf–variable=几何图形:横向输出文件


由Refael Kohen开发(refael.kohen@gmail.com

生命科学核心设施的生物信息学部门(LSCF),

魏茨曼科学研究所

基于python包互操作。

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