Python APEC-1.2.2.tar.gz模块包
下面是该Python项目安装包的资源下载地址:
APEC-1.2.2.tar.gz.source
文件名称:APEC-1.2.2.tar.gz
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所属PyPI项目:APEC
文件大小: 24.0 kB
文件类型: Source
适用的Python版本:None
下载文件的哈希值:
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851 ℃ | 2024-06-11
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PyPI项目包:APEC
APEC用户指南(v1.1.0)
(基于可达性模式的表观基因组聚类)
apec可以对来自scatac-seq、snatac-seq、sciatac-seq或任何其他相关实验的单细胞染色质可及性数据进行精细的细胞类型聚类。它还可以用于评估相关基因的表达,为每个细胞簇寻找差异的基序/基因,寻找超级增强子,并构建伪时间轨迹(通过调用monocle)。如果用户已经从其他映射管道(如cellranger)获取了每个峰值矩阵的片段计数,请从第一部分"从片
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